最后大结局是，花爷爷死了，连城死了连曦成为了皇帝，马湘云死了，丽妃疯了，孟祈佑也死了。

在大结局中，马馥雅和弟弟度云赵匡胤一起回国，在之后，马馥雅发现连城的妹妹还活着，但是已经不能动了，原来是弟弟度云弄的，很多事情都是她误会了大家，都是度云做的，这让马馥雅不敢相信，在度云登基的时候，马馥雅给弟弟戴上皇冠直接杀了弟弟，把一切都给了赵匡胤

小说中馥雅为救祈佑准备嫁给连曦，却听说祈佑已在牢中自杀。她一夜白了头，从此昏迷不醒十一年，十一年后，初雪为昏迷着的馥雅跳舞。然后去找连曦，原来这些年初雪一直在给连曦下毒，馥雅醒了，悬梁自尽。连曦听后挣

《倾世皇妃》结局是：连曦登基，馥雅无意中得知弟弟的罪行，于是为了天下忍痛杀害弟弟。之后，她把兵权交给了赵匡胤，最后馥雅离开深宫，来到相思湖畔，去找祈佑，只因她答应祈佑会陪他在这相思湖畔到老。

虽然电视剧《倾世皇妃》的最后一幕是马馥雅和孟祈佑在相思湖畔重逢，两人携手相依的幸福画面，但遗憾的是，这只是马馥雅脑中幻想的画面。所以，马馥雅最后没有和任何人在一起。

《倾世皇妃》的大结局是花爷爷死了，连城死了，马湘云死了，连曦当上了北汉的皇帝，祁佑自杀了，馥雅得知后一夜之间白头，得了失心疯，十年之后，上吊自杀了。